顺应潮流:仅血浆ctDNA-MRD监测的应用前景!

2022-01-24 06:27:46 来源:
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"突变被不属于MRD检验的潜力是完全一致的,希望这些进展将继续提低未来MRD检验的普遍安全性。"

当年列腺癌的MRD检验是一种灵敏且特异的类似于天气预报当年列腺癌病症血浆里面源普遍性脱氧核糖核酸(如ctDNA)相对于数量的方法有。在这种状态下,病症没有人肉眼可见的拢膜,但确实共存标准外科影象方法有不会检验到但最终会导致当年列腺癌入院的细纤拢膜。

MRD,常会称为细纤残余拢膜(Minimal Residual Disease)。可用“Minimal” (细纤)这个词,是因为它在典籍和外科人类学家里面日益常会用。不过,“Minimal”这个词有可能很强“误导普遍性”,因为低经常性的病变在生存领军和病人议程方面也有可能很强举足轻重涵义。“Measurable”(可校准)一词可日益精确地描绘残余在产妇血浆的肿肉瘤细胞的共存。NCCN指南同时可用了“Minimal Residual Disease”(细纤残余拢膜)和“Measurable Residual Disease”(可校准残余拢膜)两个术语。

此外,建议书证明在小分子经常性上检验多种当年列腺癌型式的ctDNA同样很强外科功效,典籍和外科人类学家有时也会可用“Molecular Residual Disease”(小分子残余拢膜)一词。

近来,国内外在实体里面基于ctDNA的MRD评核(ctDNA-MRD)的外科数据和证据日益多,开启了实体肉瘤MRD检验的热潮。实体肉瘤ctDNA-MRD检验的新技术流派主要有两大类:

1)Tumor-informed assays(知情比对)

对原发秘密一组织进行时测序以鉴定病症的选择普遍性状一组变异图谱,然后的设计引物定制panel或可用浮动panel进行时个普遍性解构的ctDNA检验比对。

2)Tumor-uninformed assays(不知情比对)

也可以称为Tumor-agnostic assays或Tumor-naïve assays,即不必原发秘密一组织,数发挥作用一一组预先选定引物/探针的设计的与当年列腺癌型式无关的浮动panel进行时ctDNA检验比对,常会在检验ctDNA普遍性状的同时,辅以ctDNA突变或相片一组学等多一组学方法有。弥补了秘密一组织比对严重不足或天气预报启动子严重不足或TAT过长等问题。

Tumor-informed assays的新技术策略日益符合大众所的认知,在保证低选择普遍性的当年提下,可通过天气预报多启动子的sample-level(比对经常性)再进一步提低其孔径,新技术下限相对于来说不是同样低。Tumor-uninformed assays的新技术策略日益类似于早筛,通过提低site-level(启动子经常性)检验孔径并辅以ctDNA突变或相片一组学并拢合机器学习于是以则传达式再进一步提低其孔径和选择普遍性,新技术下限相对于来说较低。

2021年4翌年29日,《Clinical Cancer Research》离线发表了“数可用肝脏ctDNA检验拢直肠癌病症细纤残余拢膜(MRD)”的文章,首次引起争议了Guardant Reveal的研究工作数据:MRD检验孔径约超越91%,选择普遍性约达100%,这些发现支持了数肝脏ctDNA-MRD检验(Tumor-uninformed assays)的潜在外科应用。

2021年8翌年13日,《Clinical Cancer Research》离线发表了“顺应潮流:数肝脏ctDNA-MRD检验的应用当年景”的文章,在这里研究工作者们讨论评核了数肝脏ctDNA检验MRD的控制能力,以及将突变紧密拢合到ctDNA检验的潜在某种程度。2

Parikh及其熟人1 和Taieb及其熟人3 讨论了数肝脏ctDNA-MRD检验在拢直肠癌(CRC)病症里面的潜在外科应用。

▲ ctDNA突变和普遍性状在两项研究工作里面的应用比较(Parikh和Taieb)

拢直肠癌(CRC)的病人基本上面临着一个挑战,即较多的CRC病症因早期病因入院而过早遇害。尽管外科选用了标准的专门的设计病人,但低风险IIIC期CRC病症的5年生存领军也数有53%,究其原因是没有人发现具体方法上未检验到的细纤残余拢膜(MRD)。4

目当年,仍迫切需精确已确定哪些病症术后共存MRD,以帮助他的学生降低或增加专门的设计病人,并增加治愈的日益进一步,同时尽有可能地降低过多病人的无关毒普遍性。

在过去的几年里,我们对ctDNA在CRC诊断和生存领军里面的应用有了为广泛的明白。目当年,基于ctDNA的MRD评核于是以为广泛类似于当年列腺癌的病人里面。

ctDNA是由DNA的短相片一组成(大约130-150bp),由肿肉瘤细胞通过增殖、坏死或分泌释放到消化道里面。 ctDNA的半衰期较短致使其成为敏感的系统会超载圣万,它的共存有可能突显了具体方法上好比的纤转移。

在治愈普遍性病人拢束后,ctDNA里面浮现的染色质普遍性状对随后的具体方法入院很强较低的感染普遍性预测效用,同样是当这些普遍性状与开刀的秘密一组织里面的普遍性状相匹配时。检验这种ctDNA判别的MRD可以在I-III期CRC里面提当年具体方法数翌年预测入院,从而为一一组最终会入院的CRC病症备有一个评核新疗法的窗口。然而,这些ctDNA基本概念普遍性状判别的MRD检验方法有的孔径基本上是有限的,迫切需优化其检验普遍安全性。

ctDNA的突变检验要强ctDNA的基本概念普遍性状检验。ctDNA的突变间歇普遍性在CRC里面非常会类似,并被看做大多数皮肤癌的早期阶段。这种突变,具体判别为DNA里面胞嘧啶的C5位置添加甲基基团,调控附近普遍性状的表约达,包括经典的抑癌普遍性状失活。与基本概念普遍性状相对于,CRC里面共存日益多的突变间歇普遍性区域,为提低MRD检验的孔径备有了机会。SEPT9,就是第一个利用血浆检验单普遍性状突变间歇普遍性进行时筛查和早期检验CRC的方法有。尽管ctDNA突变有这些优点,但这些相同的特普遍性也需谨慎,以保持检验比对的选择普遍性,并尽量降低;也感染普遍性的日益进一步。

在这种背景下,Parikh和Taieb的正因如此最新研究工作拢果为我们对ctDNA普遍安全性的理解备有了有用的补充,即不必原发秘密一组织,数通过血浆ctDNA突变或倡议ctDNA普遍性状即可进行时精确的MRD评核。与其他需对原发秘密一组织进行时测序以他的学生原先ctDNA比对的检验不同,正因如此研究工作论述了Tumor-uninformed assays的有效普遍性,它有几个军事优势,包括加速的TAT,降低初始成本高,对秘密一组织严重不足或不可用的病症进行时天气预报。

Parikh等人备有了一种ctDNA突变拢合ctDNA基本概念普遍性状的浮动panel进行时MRD的比对评核(NGS方法有),与其他商业活动上可用的MRD检验方法有相对于,这种方法有不需开刀的秘密一组织以及定制解构。在最终病人后可用时,这种数肝脏ctDNA-MRD检验对入院很强外科涵义的选择普遍性(100%)和孔径(55.6%),通过紧密拢合一般说来普遍性状一组特征和纵向天气预报比对,其孔径可再进一步提低至91%。1 该方法有被类似于于是以在进行时的当年瞻普遍性研究工作,包括他的学生IIA期拢肠癌病人议程的NRG合作开发一组研究工作(NCT04068103)。虽然还需额外的数据集来可验证这些发现,但这些拢果证明了基于ctDNA的MRD检验在不知情的情况下可接受的检验普遍安全性特征。

Taieb等人的研究工作利用了一对先当年被证明是CRC开刀后生存领军无关的突变普遍性状标记物WIF1和NPY(ddPCR方法有),并将它们类似于PRODIGE-GERCOR IDEA-France次测试,将III期CRC病症随机分为3个翌年 vs 6个翌年的专门的设计解构疗。在对参加III期次测试的III期CRC病症进行时的首次ctDNA-MRD评核里面,有13.8%的病症术后为ctDNA-MRD感染普遍性,并被核实为法理的生存领军圣万。3 同时,研究工作者也指显现出,与其他选用NGS方法有的ctDNA-MRD研究工作相对于,本研究工作里面ctDNA的感染普遍性领军较低。孔径和PPV同样低于NGS检验拢果,ctDNA-MRD感染普遍性和阴普遍性的5年DFS分别为65%和73%,尽管专门的设计病人的和不单纯的当年比对比对处理方式有可能会对这些拢果产生阻碍。该方法有在在的是其相对于简单,非常会低的成本高和潜在的再现普遍性,不需商业活动检验里面所见的专利权检验方法有。于是以在进行时的当年瞻普遍性研究工作将再进一步评核数肝脏ctDNA检验是否能够精确评核MRD,以便对CRC病症进行时风险分层,并他的学生专门的设计病人议程。

无论选用何种方法有,数用肝脏ctDNA-MRD检验来他的学生CRC病症的病人要求,需可靠且精确的检验方法有。需再进一步提低数肝脏ctDNA-MRD检验的孔径来已确定哪些病症可以从病人降级里面单单,以过多不恰当地选择低危病症接受较低强度的病人。Parikh及其熟人的研究工作拢果证明,紧密拢合普遍性状一组和一般说来普遍性状一组以及纵向肝脏天气预报,可显著提低数肝脏ctDNA-MRD的孔径。相对于之下,ctDNA-MRD检验的低选择普遍性对于ctDNA作为一个完整的生物圣万来已确定病人换装是至关举足轻重的。由于选择普遍性严重不足,;也感染普遍性的ctDNA-MRD有可能会使病症接受过多的强解构病人。Parikh及其熟人的研究工作拢果证明,除基本概念普遍性状外,还可以通过拢合一般说来普遍性状一组突变特征的比对来保持选择普遍性。Taieb等人的比对方法有的军事优势在于提低了外科特征的孔径和生存领军,但是,于是以如研究工作者承认的那样,原则上的两个普遍性状突变标记有可能不会备有与拢合基本概念普遍性状方法有的普遍安全性特征。举足轻重的是,这项工作也强调了标准比对当年前提条件的举足轻重普遍性,因为各种提取方法有可以在极大程度上阻碍ctDNA的得领军和完整普遍性。在未来会的研究工作里面,这些比对当年的考虑将变得日益举足轻重。

突变被不属于MRD检验的潜力是完全一致的,希望这些进展将继续提低未来MRD检验的普遍安全性。总之,数肝脏ctDNA-MRD的检验备有了一个奇特的机会,可用一种无创方法有来探索病人方案,并有有可能根除低危病症的纤转移普遍性拢膜。这些研究工作拢果无疑为未来会ctDNA-MRD他的学生的当年瞻普遍性外科次测试迈显现出了道路。

MRD,基本上是一个加速转型的应用,我们预计近两年有可能会浮现新的证据,要么揭示显现出MRD检验的外科功效的局限普遍性,要么揭示显现出MRD检验的其他军事优势和新用途。

简介:

1.Parikh Aparna R,Van Seventer Emily E,Siregna Giulia et al. Minimal Residual Disease Detection using a Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assay in Colorectal Cancer Patients.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

2.Bent A, Kopetz S. Going with the Flow: The Promise of Plasma-Only Circulating Tumor DNA Assays. Clin Cancer Res. 2021 Oct 15;27(20):5449-5451.

3.Taieb Julien,Taly Valerie,Henriques Julie et al. Prognostic value and relation with adjuvant treatment duration of ctDNA in stage III colon cancer: a post-hoc ysis of the PRODIGE-GERCOR IDEA-France trial.[J] .Clin Cancer Res, 2021, undefined: undefined.

4.Benson Al B,Venook Alan P,Cederquist Lynette et al. Colon Cancer, Version 1.2017, NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.[J] .J Natl Compr Canc Netw, 2017, 15: 370-398.

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